夏目教授带着他的考古团队，在长野县九郎岳的一处神秘遗迹里，发现了一口神秘的棺材。当他们打开尘封的棺盖后，释放出了恐怖的怪物。苏醒的怪物灭掉了整个考古团队的人，随后，就消失不见了。这件事发生后，就开始了出现了一系列的怪事，可怕的未知生命体接二连三地出现。立志要守护大家笑容的五代雄介，在目睹了古朗基一号的暴行后，他决定戴上腰带，成为假面骑士空我。